Ubuntu14.04 LTS 安装Doris、StaMPS、ROI_PAC

1、软件下载网址:

1)Doris下载网址:http://doris.tudelft.nl/
2)Doris软件最新的信息总可以在这个网址上查到:http://enterprise.tudelft.nl/doris/

3)StaMPS官方网址:http://homepages.see.leeds.ac.uk/~earahoo/stamps/

4)SNAPHU:(Statistical-Cost,Network-Flow Algorithm for Phase Unwrapping):http://web.stanford.edu/group/radar/softwareandlinks/sw/snaphu/

FFTW:http://www.fftw.org/

Triangle:http://www.cs.cmu.edu/~quake/triangle.html

Showme:http://www.cs.cmu.edu/~quake/showme.html

2、需要的软件包

[Matlab矩阵实验室]:Mathworks.Matlab.R2010a.UNIX.ISO-TBE
fftw-3.3.3 快速傅里叶变换
doris_v4.06 InSAR
getorb_2.3.2 获取精轨(ERS、ENVISAR)
snaphu-v1.4.2 相位解缠
ROI_PAC_3_0_1 InSAR,可以(成像)处理裸数据
StaMPS_v3.3b1 PS-InSAR
Triangle 构建三角网
terrasar插件

3 常用软件工具

1)、安装新立得:

$sudo apt-get install synaptic

2)、安装gawk gcc g++ make tcsh csh gmt

$sudo apt-get install gawk gcc g++ make tcsh csh gmt

3)、 安装terrasar-x影像包:

$ sudo apt-get install gdal-bin libxslt1.1 python-lxml python libxml2

4)、安装Cosmo-SkyMed影像包:

$sudo apt-get install python-h5py

注:新立得下载的安装包文件存放在:/var/cache/apt/archives/ 目录下

3、安装路径安排

1)doris_v4.06beta2、StaMPS_v3.3b1、Vi_StaMPS目录并列位于StaMPS下,即/home/lu/StaMPS/

2).bashrc位于主路径下(属于隐藏文件,ctrl+H),即/home/lu/

3)doris_v)406beta2下:fftw3.3.3、getorb、snaphu-v1.4.2

4)StaMPS_v3.3b1下:triangle、 ROI_PAC_3_0_1

5) /home/lu/StaMPS/StaMPS_v3.3b1/ROI_PAC_3_0_1/ROI__PAC/下:自己手动新建一个NetDist文件夹,NetDist文件夹下放fftw3.3.3的压缩包

6) SAR_FILES文件夹(包含INS、ODR、VOR三个文件夹)存放精轨数据,放在ROI_PAC_3_0_1/POI_PAC文件夹下

4、联网操作

普通用户获得root权限:sudo passwd root
 注意:联网设置前需要设置root密码
联网安装设置:
(操作:编辑链接——>选中以太网Wired connection 1编辑设置IPV4再在终端输入a,b,c对应的指令即可。)
(1)编辑网络连接:手动设置IP、NETMASK、网关和DNS(IPV4如:192.168.200.124;255.255.255.0;        192.168.200.1;202.106.0.20)
(2)终端:
a. sudo /sbin/ifconfig eth0 down   //断开
b. sudo /sbin/ifconfig em1 hw ether MAC地址(如:0007E9F1B25C)
c. sudo /sbin/ifconfig em1 up //连接
 每次重启完电脑后都要重新输入a,c对应的命令,才能连上

5 安装doris4.06beta2

将解压的 fftw-3.3.3 、 getorb、snaphu-v1.4.2放到doris4.06beta2目录下,等待安装。
1)编译、安装fftw-3.3.3库

$ cd fftw-3.3.3/
 $ ./configure --prefix=`pwd` --enable-float

 注: 如果出现"./configure  Permission Denied",输入命令sudo chmod +x configure给configure赋权限。再执行./configure --prefix=`pwd` --enable-float然后回车
若按装过程出错的话,需要将安装包删除,全部重新安装。注意,--prefix=`pwd`中的斜撇是键盘上数字1边上的斜撇。【这一步configure选项可以进一步优化。我们现在的机器都支持sse,cpu都是多核心的,可以加  上--enable-sse 和 --with-combined-threads选项,也就是下面的命令:$./configure --prefix=`pwd` --enable-float --enable-sse --with-combined-threads
//特别的,如果是32位linux系统,用的是amd的cpu,可以加上 --enable-k7】

$ make
$ make install

编译安装,注意--prefix=`pwd`选项保证了fftw库直接安装在pwd,也就是当前的 fftw-3.3.3目录,doris编译时会直接找到自己目录下的fftw。

2)编译安装doris

$ cd src
   //进入到doris下面的src目录
$ ./configure
$ make
$ sudo make install
//最后一步安装doris到/usr/local/bin需要root权限

3)安装SARtools和ENVISAT_TOOLS

A.安装SARtools

$cd doris_v4.04beta4/SARtools
 $make
 $sudo make install

 $sudo apt-get install  libc6-dev-i386
 $make
 $sudo make install

B.安装ENVISAT_TOOLS

$ cd doris_v4.02/ENVISAT_TOOLS 
  $ make
  $sudo make install

4)安装getorb,snaphu,GMT
Getorb(getorb_2.3.2.tar.gz)用于获取精轨,snaphu(snaphu-v1.4.2.tar.gz)用于相位解缠

snaphu与getorb软件都放到doris目录下
A.先安装fortran包

$ sudo apt-get install gfortran

注意:修改getorb安装文件目录下Makefile文件,第34行和38行,去掉行首的注释符号“#”
FC =fc
FC =gfortran

B.再安装getorb

进入getorb目录
$ make
$sudo make install

可使用getorb检查安装是否成功
注意:拷入精轨文件的时候必须注意大小写,即轨道文件必须大写的,doris才能正确读入精轨

C.安装snaphu软件

首先到“/usr/local”文件夹下建个 man文件夹,在man文件夹下建立man1文件夹,再进入  snaphu/src下make、make install,最后make install如果提示还有一个错误,不用管

$ sudo mkdir /usr/local/man/man1  //若是fedora要分步创建
进入snaphu/src目录,make 和 sudo make install。

D. 赋执行权限
以上软件的执行文件都安装在 /usr/local/bin下面,到该目录里面去检查一下,发现有几个文件没有执行权限,增加执行权限即可。

$ cd /usr/local/bin
$ sudo chmod 755 *.*
$ sudo chmod 755 *

在终端运行run -g时提示添加PAGER,EDITOR到环境变量。编辑/home/lu.bashrc文件(为隐藏文件,Ubuntu下Ctrl+H显示),在最后加入下面两行代码:

export PAGER=less
export EDITOR=vi

6、 安装matlab2010a
1) 挂载光盘镜像

$ sudo mount -o loop /home/aaa.iso /media

其中/home/aaa.iso为你的matlab安装文件所在位置(.ios文件的路径不能有空格,可以将iso放在主文件夹下),/media为你要把光盘镜像文件挂载到的

2)安装matlab

$ cd /media(挂载的位置)
$ sudo ./install 
注意:选择是否在线安装时,选否,即 install manually without using the internet
建立文件夹 sudo mkdir /usr/local/matlab,给权限sudo chmod777 路径
输入key,输入 36096-53477-64319-46930-25628-45918-00806
安装完成破解需要 license file ,选择镜像文件crack中的 license_standalone.dat

在终端运行Matlab时,提示没有注册,则需要以管理员的身份注册。
注册Matlab:sudo nautilus以管理员的身份打开文件管理器,找到Matab安装目录,文件系统下:/usr/local/MATLAB/R2012b/bin找到matlab,运行,提示注册,按上面的方法注册即可。(若运行matlab时,只能以文件的形式打开,不能执行matlab,则为matlab添加快捷方式,sudo nautilus打开文件管理器,找到桌面上的快捷方式,双击,再注册即可)

Matlab 中文乱码 解决方法:

1、Matlab2010的JRE目录为:/Matlab安装目录/sys/java/jre/glnx86/jre* 请根据自己的安装目录和版本确定JRE的目录;
2、$ cd /Matlab安装目录/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/fonts/;
3、建立目录: $sudo mkdir fallback (文件夹必须命名为fallback,原因未知);也可手动建立:sudo nautilus以管理员身份打开文件管理器,在fonts文件夹下建立fallback文件夹。
4、把字体复制fallback目录,选择其中之一就可以:
 (1) Windows 的simsun字体
$ cp /media/Windows/WINDOWS/Fonts/simsun.ttc fallback/ 
(2) 也可手动将simsun复制到fallback目录下。需要以管理员的权限打开文件管理器,将simsun复制进去,执行命令为:sudo nautilus(以管理员身份打开文件管理器)
 5、进入到 fallback目录,执行sudo mkfontscale 命令;
 $ cd fallback
 $ sudo mkfontscale
(若不成功,需要以root的身份执行mkfontscale)执行成功会在fallback文件夹下生成font.scale文件。
 6、回到上一级菜单:
 $ cd ..
 7、将上一步生成的文件添加到 lib/fonts/fonts.dir文件中,可用以下命令完成,当然也可以用编辑器复制粘贴:
$ sudo cat fallback/fonts.scale >> fonts.dir 
若提示权限不够,则执行sudo chmod a+w fonts.dir,让fonts.dir有可写的权限;再执行sudo cat fallback/fonts.scale >> fonts.dir,将font.scale的内容写到font.dir;
8、若此时打开matlab仍不能识别中文,则执行sudo chmod a+r fallback/*
9、至此Matlab的Java环境中文支持安装完了,接下来配置Matlab;
10、进入Matlab,应该直接能显示出来;没有的话选择 菜单 File>>Preferences>>Fonts 选择SimSun/wqy字体就行了
(注意这时是选择第二项desktop text font,意识是修改文件夹选项的字体,勾掉对号,选择最下面三个方块选项字体中任意一个,这3个就是我们刚添加的);选择字体的选择框依然为方块  但是系统中可以显示中文.

7、安装stamps 、triangle

$ cd StaMPS_v3.2.1/src
$ make
$ sudo make install

$ cd triangle
$ make
$ sudo make install

若装不上就下载安装

$ sudo apt-get install triangle-bin

8、ROI_PAC安装

1)预处理

A.解压缩

$tar xvf ROI_PAC_3_0_1.tgz

B.进入目录ROI_PAC_3_0_1

$cd /home/lu/StaMPS/StaMPS_v3.3b1/ROI_PAC_3_0_1

这个目录下面有一个AAREADME文件,主要是介绍一些文档,稍微看一下就好。
C.进入目录/home/lu/StaMPS/StaMPS_v3.3b1/ROI_PAC_3_0_1/ROI_PAC

$cd ROI_PAC

下面安装过程参考该目录下的AAREADME_BUILD_ROIPAC文件,值得仔细研究一下。
D.检查编译器

$ which ifort g95 f90 pgf95 f95 xlf gfortran cc gcc icc

2)准备安装
A.安装文件标签更新
(查看当前系统时间是否正确,在新安装的Ubuntu系统上,一般时间都不对,连上网后,设置为上海时间)

$ touch aclocal.m4 Makefile.in configure

也就是说把这几个文件的时间标签更改为当前时间

dawei

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